北京大学计算中心成立于1963年，行政隶属于数学力学系。中心配备了一台103电子管计算机，这在当时开创了中国高校拥有计算机并为全校提供计算服务的先河。计算中心由徐翠薇负责，王丕显为机房负责人，机房设在北京大学昌平校区200号。103计算机是仿制前苏联的M-3电子管计算机，运算速度为30次/秒，用磁鼓做内存，存储容量为1024字，字长为32位、定点。
为使用、管理、维护、整修这台103机，计算中心组建了三十多人的专业技术队伍。这其中大部分人员，在1969年后作为重要技术骨干，参与了我国第一台每秒运算100万次的集成电路电子计算机（150机）研制工作，为150机的成功研制做出了重要贡献。150机研制成功后，为解决学校教学和科研使用计算机的需求，北京大学在研制“150”百万次计算机的基础上，组织原班人马研制一台十几万次运算能力的计算机，即6912机。
1972年学校从数学力学系抽调教师重组计算中心，由唐世渭任主任，孙玉芳任副主任，陆玉英任党支部书记，专门负责6912机的运行、维护和上机计算。计算中心党政关系隶属于数学力学系，机房设在北阁，配置了一台我校自己研制的6912机。6912机的注册名称是DJS-18，是中小规模集成电路多道程序计算机，运算速度为每秒钟15万次，内存容量为65K字，字长为48位。6912机于1974年9月起正式启用，每天24小时运行。在国内计算机十分匮乏的情况下，该机有力保障了我校师生计算机教学实习和科研计算，同时，吸引了校外320多个单位来上机。
1974年至1979年，该机提供有效使用机时30000多小时。据不完全统计，该机所提供计算支持的科研课题中有近千项取得了丰硕成果，北京大学在1978年全国科学大会上获奖的66个科研项目中有一半是通过该机进行计算完成的。
1983年，北京大学对计算中心进行了整合和扩充，用首批世界银行贷款购买了美国HONEYWELL公司的DPS8系列中心计算机，继续为全校师生提供更加完备的计算服务。
1985年计算中心被确立为处级建制单位，成为面向全校教学、科研服务的大型实验室。计算中心从北阁迁至红二楼，在编人员60多人，下设运行室、应用室、CAD室、动力室、微机组、技术开发咨询部和办公室。伴随着北京大学的发展，计算中心的工作职责不断丰富和拓展。在技术进步的推动下，计算中心逐步发展成为一个集计算中心、管理信息中心和网络中心三位一体的实体单位。
作为独立建制的全校大型综合实验室，计算中心在北京大学信息化建设中发挥着主力军的作用。 校园网基础设施从无到有，无线网建设取得领先地位，电子校务系统迅猛发展，微机教学服务惠及全校师生，网络安全体系建设初见成效，高性能计算服务日趋完善，网络信息服务不断提升……
在全体教职工的共同努力下，计算中心面向全校提供校园网和电子校务服务，为全校的计算机教学和高性能计算提供实习和计算环境，为北京大学的人才培养、学科建设、科学研究和行政管理提供了良好的技术支持和服务保障，引领着中国高校信息化建设的前进和发展。
党的十八大以来，党中央就加快建设网络强国、数字中国作出一系列新部署新论断。北京大学计算中心以此为根本遵循，明确了前进方向，迎来了高质量发展的时期。
十余年来，计算中心顺应信息时代浪潮，把握新机遇，塑造新优势，积极响应师生新期待，成功搭建了智慧校园基础设施、支撑平台、应用平台和信息服务“四个平台”，提升了智慧教学环境、智慧科研平台、智慧校园管理、智慧校园服务“四个服务”，在智慧校园建设中不断取得新成就、实现新发展。 从日常生活的吃、住、行，到师生的办公、学习、交流，再到全校的教学、科研、管理，数字技术在北大校园的广泛应用使教育理念、教育方式的数字化转型加速推进，使多项便民利民惠民服务加快普及……
计算中心在数字赋能高等教育高质量发展方面的积极探索和创新实践,逐渐形成了多项可复制、可推广的成果与案例，努力为建设网络强国、数字中国贡献了北大经验和北大智慧。
